Akademik geçmişiyle dikkat çeken Altun, İstanbul Üniversitesi Sosyoloji Bölümü'nden mezun olmuş, ardından yüksek lisans ve doktorasını Boğaziçi Üniversitesi’nde tamamlamıştır. Medya ve siyaset ilişkileri üzerine çalışmaları bulunan Altun, daha önce akademisyen ve medya yöneticisi olarak da görev yaptı.
Cumhurbaşkanlığı İletişim Başkanlığı bünyesinde yürüttüğü görevlerle; dezenformasyonla mücadele, uluslararası medya stratejileri ve Türkiye'nin dijital diplomasi hamleleri konusunda öncü projelere imza atan Altun, kamuoyunda sık sık açıklamalarıyla da gündeme geliyor.
Son dönemde özellikle Filistin meselesi, dijital platformlardaki bilgi güvenliği ve Türkiye’nin küresel iletişim vizyonu gibi başlıklarda yaptığı çıkışlarla dikkat çeken Fahrettin Altun, devletin iletişim ayağındaki en etkili isimlerden biri olarak öne çıkıyor.